Il settore valtellinese del parco è caratterizzato dalla presenza di ecosistemi forestali notevoli.
Il versante orografico sinistro della Valfurva è ricoperto da un’estesa copertura di abete rosso, pino cembro e larice, che rappresenta la più bella foresta d’alto fusto di conifere dell’intera Valtellina.
La bassa valle dei Forni è interessata dalla presenza di una pineta pura di pino cembro, un esempio importante delle foreste di clima continentale freddo delle valli alpine interne.
Tutto il versante della cresta di Reit, del Monte Scale e della valle di Fraele è ricoperto da estesissime formazioni di pino mugo che rappresentano, per estensione, il popolamento più importante delle Alpi Centrali italiane.
Accanto alla forma prostrata assai comune nelle Alpi Orientali, il pino mugo nella valle di Fraele si presenta anche con la forma eretta più frequente nei settori occidentali del suo areale e nelle valli engadinesi.
Particolarmente interessante è il complesso di brughiere di altitudine che si estendono al di sopra del limite del bosco.
Attigue ai pascoli ed ai maggenghi di valle si colorano d’oro nei mesi autunnali regalando suggestioni indimenticabili.